Продолжение приключений Флинта Локвуда и его друзей в мультфильме “Облачно 2: Месть ГМО”. После того, как Флинту при помощи его друзей удалось спасти мир от продовольственного шторма, генеральный директор корпорации The Live Corp – Честер, он же кумир Локвуда, ставит ему задачу вернуться на свой родной остров, так как там происходит что-то странное.
Флинт Локвуд в сопровождении своих верных друзей приплывают на остров, и их взглядам открывается необычная панорама. Оказывается, изобретенная им машина работает и создает самые немыслимые существа, которые разгуливают по покрывшемуся необычными джунглями и теперь уже полностью преображенному острову.
Неожиданно к их экспедиции присоединяется Честер, чему в начале обрадовался Флинт.
Но, как покажут дальнейшие события, то оказывается, у Честера были свои планы…